Kalsít dreifist víða í náttúrunni.
Í grunnum sjó eða vötnum sest það oft og myndar umfangsmikil kalksteinslög.
Grunnvatn getur leyst upp kalkstein og einnig umbreytt kalsít, svo sem í stalaktítum, stalagmítum og travertíni. Grunnvatn virkt í jarðvegi nálægt vatnsborðinu myndar oft kalsíthnúða sem dreifast eftir ákveðnu láréttu plani; Jarðfræðingar vísa oft til þessara sem kalkhnúða.
Vatnshitavirkni myndar oft kalsítæðar, sumar innihalda steinefni og aðrar ekki. Vel-myndaðir kristallar finnast oft í landaröðum.
Í karbónötum sem myndast við kvikuvirkni er kalsít venjulega um 80%.
Ennfremur virkar kalsít einnig sem sement í klesstískum setbergum og sem steinefni sem er unnið úr breytingum á grunngjóskubergi og stuðlar að ýmsum bergtegundum. Vegna grunnvatnsvirkni fylla kalsítæðar oft sprungur ýmissa steina.
Kalksteinn sem myndast við setmyndun verður oft fyrir svæðis- eða snertibreytingu, þar sem kalsítið í honum endurkristallast og myndar grófari kalsítsamstæður-marmara.
